船舶合同糾紛一旦發(fā)生，當(dāng)事人可以根據(jù)《中華人民共和國民事訴訟法》的相關(guān)規(guī)定向法院提起訴訟，并申請扣押船舶。

首先，當(dāng)事人需要向具有管轄權(quán)的人民法院遞交起訴狀，并在起訴狀中清楚陳述糾紛的事實(shí)、理由和請求。同時(shí)，提供證據(jù)支持自己的主張，以便法院能夠準(zhǔn)確理解案件的情況。

根據(jù)中華人民共和國民事訴訟法第110條的規(guī)定，若當(dāng)事人在起訴狀中申請扣押船舶，法院會在符合法律規(guī)定的條件下進(jìn)行審查。具體條件如下：

1. 糾紛金額較大：根據(jù)《中華人民共和國海商法》第114條的規(guī)定，扣押船舶的糾紛金額應(yīng)當(dāng)高于一定數(shù)額，具體金額標(biāo)準(zhǔn)根據(jù)法律規(guī)定而異。

2. 有合理事由：當(dāng)事人需要提供足夠的證據(jù)證明有合理的事由抵押船舶。例如，合同明確規(guī)定了違約責(zé)任、貨物損壞或失蹤等情況，當(dāng)事人可以根據(jù)合同約定來申請扣押船舶。

3. 提供擔(dān)保措施：當(dāng)事人在申請扣押船舶時(shí)需要提供擔(dān)保措施，確保申請的合法性和有效性。常見的擔(dān)保方式包括提供保證金、提供擔(dān)保函等。

當(dāng)事人提起扣押申請后，法院會依法對案件進(jìn)行審理，并在審理過程中進(jìn)行相應(yīng)的調(diào)查取證。如果法院認(rèn)為當(dāng)事人的申請符合法律規(guī)定，法院會作出扣押船舶的裁定決定，并通知船舶管理機(jī)構(gòu)、海關(guān)等相關(guān)部門進(jìn)行扣押。

一旦船舶被扣押，船東可以提供擔(dān)保并向法院申請解除扣押，船東需要提供合法合理的擔(dān)保措施，以確保當(dāng)事人的合法權(quán)益不受損失。

總之，船舶合同糾紛的扣押程序需要當(dāng)事人充分了解相關(guān)法律規(guī)定，并根據(jù)規(guī)定的條件申請扣押。同時(shí)，當(dāng)事人需要提供充分的證據(jù)和擔(dān)保措施，以確保申請的合法性和有效性。法院在審理過程中會依法進(jìn)行裁決，保護(hù)當(dāng)事人的合法權(quán)益。