勞動(dòng)合同糾紛補(bǔ)償工資的方式一般依據(jù)勞動(dòng)法和勞動(dòng)合同法或相關(guān)勞動(dòng)法規(guī)的規(guī)定進(jìn)行處理。下面是一種常見(jiàn)的處理方式：

1. 協(xié)商解決：首先，雙方可以協(xié)商解決勞動(dòng)合同糾紛，如果雙方能夠達(dá)成一致，可以根據(jù)雙方的約定進(jìn)行工資補(bǔ)償。雙方可以商議支付未支付的工資、加班費(fèi)、提成等。

2. 勞動(dòng)仲裁：如果協(xié)商無(wú)果，雙方可以申請(qǐng)勞動(dòng)仲裁，由勞動(dòng)仲裁機(jī)構(gòu)進(jìn)行仲裁。仲裁機(jī)構(gòu)會(huì)根據(jù)勞動(dòng)法和勞動(dòng)合同法的規(guī)定，以及雙方提供的證據(jù)材料，作出公正的仲裁決定。如果勞動(dòng)仲裁判決雇主違法解除勞動(dòng)合同，一般會(huì)要求雇主支付被解雇員工的經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償。經(jīng)濟(jì)補(bǔ)償包括未支付的工資、加班費(fèi)、獎(jiǎng)金、年終獎(jiǎng)等。

3. 法院起訴：如果勞動(dòng)仲裁無(wú)法解決勞動(dòng)合同糾紛，雙方可以向法院提起訴訟。在法院審理過(guò)程中，法官會(huì)根據(jù)法律和事實(shí)證據(jù)判斷工資補(bǔ)償?shù)木唧w金額。一般而言，法院會(huì)要求雇主支付未支付的工資、加班費(fèi)、提成、補(bǔ)償金等。

需要注意的是，在勞動(dòng)合同糾紛中，具體的補(bǔ)償金額會(huì)受到多種因素的影響，例如勞動(dòng)合同的具體規(guī)定、雙方的實(shí)際履行情況、勞動(dòng)法規(guī)定的最低工資標(biāo)準(zhǔn)等。因此，對(duì)于勞動(dòng)合同糾紛，雙方最好通過(guò)協(xié)商、仲裁或訴訟等合法途徑解決，以維護(hù)自己的合法權(quán)益。