專利合同糾紛的處理方法包括以下幾個步驟：

1. 先檢查合同條款：仔細審查合同條款，確定合同中關(guān)于專利權(quán)的約定是否明確，是否存在爭議的解釋空間。

2. 協(xié)商解決：雙方可以通過友好協(xié)商解決糾紛。可以通過會議、電話或書面通信等方式與對方進行交流，并提出解決方案。

3. 訴訟或仲裁：如果協(xié)商無法解決爭議，可以選擇提起訴訟或仲裁。選擇合適的法院或仲裁機構(gòu)，提交相關(guān)證據(jù)和材料，依據(jù)法律維護自己的合法權(quán)益。

4. 調(diào)解和和解：在訴訟或仲裁過程中，雙方可以選擇提請調(diào)解或和解。調(diào)解和解具有快速解決爭議、減少成本和保持雙方關(guān)系的優(yōu)勢。

5. 申請專利權(quán)的無效宣告：如果合同糾紛與專利的有效性有關(guān)，可以向相關(guān)部門發(fā)起專利權(quán)的無效宣告請求，通過無效宣告來解決爭議。

在處理專利合同糾紛時，需要保護各方的合法權(quán)益，維護合同的效力，并遵守相關(guān)法律規(guī)定。同時，及時與專業(yè)律師咨詢，尋求法律意見，以確保得到合理和公正的解決方案。