工程建設合同糾紛可以通過以下幾種方式解決：

1. 協(xié)商解決：雙方可以通過協(xié)商的方式，就爭議事項達成一致意見，并簽署補充協(xié)議或撤銷合同。

2. 第三方調解：聘請獨立的第三方調解機構或專業(yè)人士進行調解，以幫助雙方達成和解協(xié)議。

3. 法院訴訟：如果協(xié)商和調解都無法解決爭議，雙方可以將爭議提交給法院，通過合同糾紛訴訟程序解決。

4. 仲裁解決：如果合同中約定了仲裁條款，雙方可以選擇仲裁作為糾紛解決方式。一般通過仲裁委員會或仲裁機構進行裁決。

無論選擇哪種方式解決糾紛，雙方都應當準備充分的證據(jù)材料，以支持自己的主張，并遵守相關法律法規(guī)和合同約定。同時，及時咨詢專業(yè)的法律顧問也是解決合同糾紛的重要步驟。