處理工程協(xié)議合同糾紛可采取以下步驟：

1.了解合同條款：仔細(xì)閱讀合同條款，確定各方的權(quán)利和義務(wù)。了解雙方應(yīng)遵守的合同規(guī)定，以及是否存在任何解決糾紛的條款。

2.協(xié)商解決：雙方可嘗試通過(guò)友好協(xié)商解決糾紛。可以通過(guò)面對(duì)面或書(shū)面溝通，表達(dá)各自的立場(chǎng)和要求，并尋找共同的解決方案。如果達(dá)成共識(shí)，可簽訂書(shū)面協(xié)議以解決糾紛。

3.第三方調(diào)解：如果雙方無(wú)法通過(guò)協(xié)商解決糾紛，可以尋求第三方的調(diào)解幫助。可以選擇專(zhuān)業(yè)的糾紛調(diào)解機(jī)構(gòu)或律師進(jìn)行調(diào)解，以找到雙方都能接受的解決方案。調(diào)解通常是快速和經(jīng)濟(jì)的解決方法。

4.仲裁：如果調(diào)解未能解決糾紛，雙方可選擇進(jìn)行仲裁。仲裁是一種非訴訟的糾紛解決方法，由獨(dú)立的仲裁機(jī)構(gòu)或個(gè)人進(jìn)行裁決，根據(jù)合同和相關(guān)法律進(jìn)行裁決。雙方需按照仲裁機(jī)構(gòu)的程序進(jìn)行申請(qǐng)和提交相關(guān)證據(jù)。

5.訴訟：如果仲裁也未能解決糾紛，雙方可以選擇通過(guò)訴訟解決爭(zhēng)議。當(dāng)然，訴訟手續(xù)費(fèi)用較高，并且可能耗費(fèi)大量時(shí)間和精力。

在處理工程協(xié)議合同糾紛時(shí)，雙方應(yīng)理性對(duì)待，保持良好的溝通和合作態(tài)度。如果有需要，可咨詢專(zhuān)業(yè)律師以獲得法律意見(jiàn)和幫助。最終的目標(biāo)是公正、公平地解決糾紛，并維護(hù)各方的合法權(quán)益。