對于違建建廠的企業(yè)，可以采取以下處罰措施：

1. 強制拆除違法建設(shè)：責(zé)令企業(yè)在一定時間內(nèi)自行拆除違法建筑，可以并處罰款。

2. 停產(chǎn)整頓：責(zé)令企業(yè)停產(chǎn)整頓，并進行環(huán)境治理，符合規(guī)定后方可恢復(fù)生產(chǎn)。

3. 撤銷相關(guān)資質(zhì)或許可證：對于嚴重違建的企業(yè)，可以撤銷其相關(guān)資質(zhì)或許可證，限制其經(jīng)營活動。

4. 罰款處罰：根據(jù)違法建筑的面積大小、違法程度等因素，對企業(yè)處以相應(yīng)的罰款。

5. 行政處罰：依法對違法行為進行行政處罰，包括警告、罰款、沒收違法所得等。

6. 刑事責(zé)任追究：對于嚴重的違法建筑行為，可以追究企業(yè)法定代表人或相關(guān)責(zé)任人的刑事責(zé)任。

綜上所述，對違建建廠的企業(yè)應(yīng)采取切實有效的處罰措施，并依法嚴格執(zhí)行，以維護建設(shè)市場秩序和公共利益。