公司轉(zhuǎn)讓涉及的合同糾紛，一般可以通過以下方式來處理：

1. 合同轉(zhuǎn)讓：在公司轉(zhuǎn)讓過程中，可以將原有合同轉(zhuǎn)讓給買方。這意味著買方承擔(dān)原有合同的權(quán)利和義務(wù)。這樣買方與原合同相對方可以繼續(xù)履約，避免合同糾紛產(chǎn)生。

2. 協(xié)商解決：當(dāng)有涉及合同的糾紛時(shí)，買賣雙方可以通過協(xié)商的方式進(jìn)行解決。可以開展合同解釋、履行情況、違約責(zé)任等方面的詳細(xì)討論，并通過協(xié)商達(dá)成一致意見，解決糾紛。

3. 仲裁或訴訟：如果協(xié)商無法解決糾紛，可以通過仲裁或訴訟的方式解決問題。然而，選擇仲裁還是訴訟，可能會(huì)受到合同中的爭議解決方式條款的限制。如果合同中約定了仲裁方式，當(dāng)事人應(yīng)該遵循約定。如果沒有約定或選擇訴訟方式，當(dāng)事人可以將合同糾紛提交至法院進(jìn)行裁決。

4. 尋求法律意見：當(dāng)面對復(fù)雜的合同糾紛時(shí)，當(dāng)事人可以尋求法律專業(yè)人士的意見。律師可以根據(jù)當(dāng)?shù)胤芍贫忍峁I(yè)意見和建議，協(xié)助當(dāng)事人解決合同糾紛。

綜上所述，公司轉(zhuǎn)讓過程中的合同糾紛可以通過合同轉(zhuǎn)讓、協(xié)商解決、仲裁或訴訟以及尋求法律意見等方式進(jìn)行處理。不同的情況可能需要采取不同的方法，取決于糾紛的性質(zhì)、當(dāng)事人的意愿以及合同中的約定。