房屋合同糾紛的管理主要分為以下幾個層面：

1. 合同履行地的法院管轄：根據(jù)《中華人民共和國民事訴訟法》規(guī)定，合同一方可以選擇將合同糾紛交由被告住所地或者合同履行地的人民法院管轄。如果在合同中約定了法院管轄地，雙方應該按照約定來選擇。

2. 仲裁機構的管理：如果合同中約定了仲裁條款，雙方應當按照約定將糾紛提交給指定的仲裁機構進行仲裁。仲裁機構依法享有對房屋合同糾紛的仲裁權，仲裁裁決具有強制執(zhí)行力。

3. 行政主管部門的管理：在一些特定的房屋合同糾紛中，涉及到行政管理的問題，雙方可以將糾紛提交給相關的行政主管部門處理。例如，如果在購買商品房的過程中出現(xiàn)合同糾紛，可以向房屋買賣的監(jiān)管部門投訴。

4. 特定機構的管理：在一些特定情況下，房屋合同糾紛還可以由特定機構來管理。例如，對于涉及國有土地使用權的房屋合同糾紛，可以由國土資源主管部門進行處理。

總的來說，房屋合同糾紛的管理主要是由法院、仲裁機構、行政主管部門和特定機構來負責。當發(fā)生糾紛時，雙方應根據(jù)合同約定或者法律規(guī)定選擇合適的管轄機構進行處理。如果無法達成一致，可以尋求法律專業(yè)人士的幫助，幫助雙方解決糾紛。