拆遷廠房涉及到的違建問題一般分為兩種情況，一種是明知違建卻依然進(jìn)行拆遷，另一種是在拆遷過程中發(fā)現(xiàn)違建問題。

對(duì)于明知違建卻依然進(jìn)行拆遷的情況，相關(guān)部門應(yīng)該采取以下措施進(jìn)行處理：

1. 暫停拆遷：首先要暫停拆遷工作，確保違建的完整性，并通知違建方進(jìn)行整改。

2. 違建處罰：依法對(duì)違建方進(jìn)行處罰，包括罰款、強(qiáng)制拆除等措施，以起到震懾作用。

3. 整改指導(dǎo)：為違建方提供整改指導(dǎo)，幫助他們制定整改方案，并提供技術(shù)支持和合規(guī)建設(shè)咨詢。

4. 監(jiān)督檢查：設(shè)立專門小組進(jìn)行監(jiān)督檢查，確保整改工作的有效進(jìn)行。

對(duì)于在拆遷過程中發(fā)現(xiàn)違建問題的情況，相關(guān)部門應(yīng)該采取以下措施進(jìn)行處理：

1. 中斷拆遷：暫停拆遷工作，并通知違建方整改。

2. 違建處置：依法對(duì)違建方進(jìn)行處罰，并要求其在一定期限內(nèi)完成整改工作。

3. 整改驗(yàn)收：組織專業(yè)人員對(duì)違建進(jìn)行整改驗(yàn)收，確保整改達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)。

4. 監(jiān)督管理：對(duì)整改后的違建進(jìn)行定期監(jiān)督管理，確保不再發(fā)生類似問題。

在處理違建問題時(shí)，需要注意以下幾個(gè)方面：

1. 依法依規(guī)：處理違建問題必須嚴(yán)格依法依規(guī)進(jìn)行，不能隨意處理。

2. 公正公平：處理違建問題要公正公平，不能給違建方造成不公平的待遇。

3. 宣傳教育：加強(qiáng)對(duì)違建問題的宣傳教育，提高公眾的違建意識(shí)和法紀(jì)觀念。

4. 同時(shí)進(jìn)行：在拆遷過程中及時(shí)發(fā)現(xiàn)并處理違建問題，以避免給整個(gè)拆遷工作帶來不必要的延誤和影響。

總之，處理拆遷廠房的違建問題需要依法依規(guī)，以公正公平的原則進(jìn)行處理，并加強(qiáng)宣傳教育，提高公眾的法紀(jì)觀念。