合同糾紛違約金全免是否合法取決于具體的法律條款和情況。在一般情況下，如果合同雙方都同意在特定條件下減免違約金，那么這樣的行為是合法的。

然而，如果減免違約金沒有合同約定或沒有經(jīng)過雙方協(xié)商一致，那么扣除或全免違約金可能會違反合同原則。根據(jù)合同法，一方違約時，另一方有權(quán)要求違約方支付違約金，這是為了保護合同的有效性和強制力。如果沒有合法合理的理由，單方面減免違約金可能會影響到合同的穩(wěn)定性和權(quán)益保護。

此外，如果減免違約金違反了國家的法律法規(guī)，例如某些法律規(guī)定了最低違約金數(shù)額，那么全免違約金就是違法的。

總之，合同糾紛違約金全免是否合法需要根據(jù)具體情況來判斷。建議雙方根據(jù)合同約定和法律法規(guī)的規(guī)定，協(xié)商解決糾紛，并確保雙方權(quán)益的合法保護。