公司合同糾紛賠款通常會計入以下費用：

1. 律師費用：為了解決合同糾紛，公司可能需要聘請律師提供法律咨詢和代理訴訟等服務。律師費用通常是公司合同糾紛賠款中的一項重要費用。

2. 訴訟費用：如果合同糾紛需要通過訴訟解決，公司需要支付相關的法院費用，例如案件受理費、訴訟保全費、出庭費等。

3. 調查費用：為了證明合同違約行為、確定損失等，公司可能需要聘請專業(yè)人士進行調查和取證。調查費用可能包括調查人員的薪酬、差旅費、取證費用等。

4. 仲裁費用：如果合同糾紛通過仲裁解決，公司需要支付相關的仲裁費用，例如仲裁機構的費用、仲裁人員的薪酬等。

5. 稅費：公司合同糾紛賠款往往需要繳納相關的稅費，例如增值稅、所得稅等。

6. 賠償款項：公司合同糾紛賠款本身也計入費用，作為合同違約方需要向受損方支付的金額。

上述費用在會計記錄中通常被列為“合同糾紛賠款費用”或類似的科目下，以便將其準確計入相關成本或費用項目，并且進行合適的分類和分析。