根據(jù)中國的法律體系，合同糾紛確實應該由司法機構(gòu)處理，而不是工商部門。工商部門主要負責企業(yè)的注冊、經(jīng)營許可、監(jiān)管等方面的事務，并不具備處理糾紛的職責和權(quán)力。

合同糾紛的處理一般需要通過訴訟程序來解決。當出現(xiàn)合同糾紛時，受害方可以選擇向人民法院提起訴訟，法院會根據(jù)相關(guān)法律和合同約定，判決糾紛一方的行為是否屬于違約并做出相應的裁決。如果有需要，法院也可以依法采取措施來保障受害方的權(quán)益。

當然，在一些特定情況下，工商部門可能會介入?yún)f(xié)助解決合同糾紛。例如，如果發(fā)現(xiàn)一方涉嫌虛假宣傳、欺詐等違法行為，工商部門可以對其進行調(diào)查并依法進行處罰。此外，工商部門也可能提供相關(guān)的法律咨詢和幫助。

然而，工商部門并不是直接處理合同糾紛的機構(gòu)，主要的職責是監(jiān)管和管理企業(yè)的合法經(jīng)營行為，確保企業(yè)按照法律規(guī)定的要求進行經(jīng)營。合同糾紛的解決主要還是依靠司法機構(gòu)來處理，雙方可以通過訴訟程序來維護自己的權(quán)益。