施工合同糾紛起訴的程序如下：

首先，需要起訴人準(zhǔn)備好相關(guān)證據(jù)材料，包括合同、支付憑證、施工過程記錄等。確保這些證據(jù)能夠支持起訴人的主張。

其次，起訴人可以通過向當(dāng)?shù)厝嗣穹ㄔ哼f交起訴狀來正式提起訴訟。起訴狀應(yīng)包含雙方當(dāng)事人的詳細(xì)信息、糾紛爭議的具體事實(shí)和理由，并注明請求法院作出的具體判決。

然后，法院會根據(jù)規(guī)定的程序?qū)ζ鹪V進(jìn)行審查，如果符合立案條件，會受理此案件。此時，法院會向被告送達(dá)起訴狀，并要求被告在一定期限內(nèi)提出答辯意見。

在開庭審理階段，雙方當(dāng)事人可以提交證據(jù)材料并進(jìn)行辯論。同時，法院也可以要求雙方提供更多證據(jù)以進(jìn)一步審理此案。

最后，法院會根據(jù)相關(guān)法律規(guī)定和雙方當(dāng)事人的陳述和證據(jù)，做出最終判決。如果一方當(dāng)事人不服判決，可以在規(guī)定的期限內(nèi)提出上訴，最終由上級法院作出終審判決。

需要注意的是，在起訴施工合同糾紛時，建議起訴人尋求法律專業(yè)人士的幫助，并遵循當(dāng)?shù)胤沙绦蚝鸵?guī)定。這樣可以增加起訴人勝訴的機(jī)會。