工程施工合同糾紛的認定主要依據(jù)合同條款、當事人行為及相關法律規(guī)定。以下是一般情況下的認定依據(jù)：

1. 合同條款：合同是雙方自愿達成的協(xié)議，其條款明確了雙方的權利和義務。如果其中某一方違反了合同條款，例如未按約定時間完成工程、未按質(zhì)量要求進行施工等，那么對方可以認定存在合同糾紛。

2. 當事人行為：當事人之間在履行合同過程中的行為也是認定糾紛的重要依據(jù)。例如，如果承包商未按照要求采取合理措施保護施工現(xiàn)場，導致施工中發(fā)生損害事故，業(yè)主可以認定承包商存在過錯。

3. 相關法律規(guī)定：在中國，工程施工合同糾紛的認定還要參考《合同法》、《建設工程質(zhì)量管理條例》等相關法律法規(guī)的規(guī)定。根據(jù)這些法律法規(guī)，施工方需要按照約定完成工程，業(yè)主則有權要求保證工程質(zhì)量、驗收合格等。當然，法律對糾紛認定還會考慮雙方的過失、不可抗力等情況。

在實際操作中，認定工程施工合同糾紛通常需要先行協(xié)商解決。如果協(xié)商無果，雙方可以向相關仲裁機構或法院提起訴訟。仲裁機構或法院會依據(jù)合同條款、當事人行為和相關法律規(guī)定來進行認定，判斷哪一方存在違約或過錯，并做出相應的賠償或責任判定。

總之，工程施工合同糾紛的認定需要綜合考慮合同條款、當事人行為和相關法律規(guī)定。只有在明確違約或過錯的情況下，才能認定存在合同糾紛，并對違約方進行相應的補償或責任追究。