商品房預售合同糾紛在法律上是合法的，因為預售合同屬于合同關系，當合同當事人之間發(fā)生糾紛時，可以通過法律途徑加以解決。

首先，商品房預售合同是依法成立的合同，雙方在簽訂合同時應遵守合同法及相關法律法規(guī)的規(guī)定。當合同當事人之間出現(xiàn)合同履行的爭議或違約情況時，可以向法院提起訴訟，通過司法程序解決爭議。

其次，預售合同作為一種特殊的合同類型，涉及了建設工程、不動產等多個領域的法律規(guī)定，包括房屋買賣法、工程建設《合同法》等。當發(fā)生糾紛時，法院將根據(jù)相關法律規(guī)定對合同的履行情況、約定內容等進行審查，并依法進行判決。

最后，法院可以根據(jù)實際情況對預售合同糾紛進行仲裁，或者進行民事訴訟。在仲裁或訴訟過程中，法院將對合同中的各項條款進行解釋和判斷，以保護合同當事人的合法權益，并制定合理的補償方案。

總之，商品房預售合同糾紛在法律上是合法的，當發(fā)生糾紛時，雙方可以依法通過仲裁或訴訟等方式解決糾紛，以維護自身的合法權益。