合同糾紛是培訓(xùn)機(jī)構(gòu)在經(jīng)營過程中可能會(huì)遇到的問題，處理方式如下：

1.重新審視合同：培訓(xùn)機(jī)構(gòu)應(yīng)首先仔細(xì)審視合同條款，確保自身理解合同內(nèi)容的準(zhǔn)確性。如果存在模糊或爭議的條款，可以與對方進(jìn)行溝通，嘗試解決分歧，或者尋求法律專業(yè)人士的意見。

2.尋求協(xié)商：如果雙方無法解決爭議，并且爭議金額較小，可以提出協(xié)商解決。通過開放、平等、誠信的態(tài)度，雙方可以盡量達(dá)成妥協(xié)，并在糾紛解決協(xié)議中明確雙方的權(quán)利和義務(wù)。

3.調(diào)解：如果協(xié)商無果，可以嘗試通過第三方進(jìn)行調(diào)解。調(diào)解員可以幫助各方溝通，尋找共同的利益點(diǎn)，并提出爭議解決方案。調(diào)解的結(jié)果不具有強(qiáng)制力，但可以幫助雙方更好地理解對方的觀點(diǎn)，并為可能的后續(xù)訴訟做準(zhǔn)備。

4.法律訴訟：如果無法通過協(xié)商或調(diào)解解決爭議，培訓(xùn)機(jī)構(gòu)可以選擇向法院提起訴訟。培訓(xùn)機(jī)構(gòu)在此過程中需要準(zhǔn)備相關(guān)證據(jù)和文件，并委托專業(yè)律師提供法律意見和辯護(hù)。

總之，培訓(xùn)機(jī)構(gòu)在處理合同糾紛時(shí)應(yīng)該積極主動(dòng)、理智處理，考慮到雙方的長遠(yuǎn)利益，通過多種途徑爭取合理解決糾紛。