單位之間合同糾紛的處理方式可以從以下幾個層面進(jìn)行考慮：

首先，當(dāng)出現(xiàn)合同糾紛時，雙方單位應(yīng)該通過友好協(xié)商的方式來解決問題。雙方可以重新研究合同條款，找出問題所在，尋求雙方都能接受的解決方案。雙方可以通過會談、電話交流、書面材料等方式進(jìn)行溝通，并且應(yīng)該保持冷靜和耐心。如果雙方發(fā)現(xiàn)存在爭議的合同條款模糊不清或有歧義，可以考慮重新修改合同或者對爭議條款進(jìn)行補(bǔ)充協(xié)商。

其次，如果友好協(xié)商的方式不能解決糾紛，雙方可以選擇進(jìn)行調(diào)解。調(diào)解可以通過中介機(jī)構(gòu)、行業(yè)協(xié)會或?qū)I(yè)法律人員進(jìn)行，調(diào)解的目的是通過公正、中立的第三方的介入來協(xié)助雙方單位達(dá)成共識。調(diào)解的過程是非正式的，沒有法律效力，但是如果雙方在調(diào)解過程中達(dá)成了共識，可以將共識內(nèi)容書面記錄下來作為解決合同糾紛的依據(jù)。

第三，如果調(diào)解不能解決糾紛，雙方可以選擇仲裁或司法訴訟的方式來解決糾紛。仲裁是通過由仲裁機(jī)構(gòu)或者仲裁委員會主持的仲裁程序來解決爭議，雙方都必須遵守仲裁結(jié)果。司法訴訟則是通過法院來解決爭議，法院會根據(jù)法律和事實裁決糾紛的結(jié)果。雙方可以根據(jù)糾紛的性質(zhì)和案件的具體情況選擇適合自己的解決方式。

最后，為了避免合同糾紛的發(fā)生，雙方在簽訂合同時應(yīng)該注重合同的條款和內(nèi)容的明確性，盡量避免使用模糊的用語或術(shù)語。合同的簽訂過程應(yīng)該充分考慮雙方的合理訴求和利益，并在有需要時尋求專業(yè)法律意見。雙方在履行合同過程中也應(yīng)該保持溝通和協(xié)商的習(xí)慣，及時解決可能出現(xiàn)的問題，避免糾紛的發(fā)生。

總之，單位之間合同糾紛的處理方式應(yīng)該以友好協(xié)商為基礎(chǔ)，同時考慮調(diào)解、仲裁和司法訴訟等方式，根據(jù)具體情況進(jìn)行選擇。對于雙方來說，避免合同糾紛的發(fā)生才是最好的解決方式。