在處理工程合同糾紛時(shí)，被告應(yīng)采取以下措施：

1. 理性對(duì)待：被告應(yīng)冷靜理性對(duì)待合同糾紛，不要情緒化地做出決策。要認(rèn)真審查合同條款，了解自己的權(quán)利和義務(wù)，并與自己的律師進(jìn)行充分的溝通和討論。

2. 保持溝通：被告應(yīng)建立和維持與原告的良好溝通機(jī)制。及時(shí)回復(fù)和解決對(duì)方的疑問(wèn)和問(wèn)題，避免因溝通不暢而導(dǎo)致糾紛進(jìn)一步擴(kuò)大。

3. 準(zhǔn)備證據(jù)：被告應(yīng)收集和整理與合同糾紛有關(guān)的證據(jù)和文件，包括合同原件、付款記錄、施工過(guò)程照片等。這些證據(jù)可以為被告辯護(hù)提供支持，并在法庭上證明自己的合法權(quán)益。

4. 尋求專業(yè)支持：被告應(yīng)尋求合適的法律專業(yè)人士，如律師或仲裁機(jī)構(gòu)的專業(yè)人員，幫助自己解決糾紛。他們能夠?yàn)楸桓嫣峁┖戏ǖ慕ㄗh和指導(dǎo)，制定有效的合理策略，并代表被告參與協(xié)商或仲裁過(guò)程。

5. 主動(dòng)解決爭(zhēng)議：被告應(yīng)積極主動(dòng)地尋求解決爭(zhēng)議的方式和途徑，如協(xié)商、談判或調(diào)解。通過(guò)與原告的協(xié)商，尋求雙方的共同利益，達(dá)成互惠互利的解決方案。

6. 遵守約定：被告應(yīng)遵守合同條款和相關(guān)法律法規(guī)的規(guī)定，確保自己的行為合法合規(guī)。同時(shí)，要盡力履行自己的合同義務(wù)，以維護(hù)自己的聲譽(yù)和信譽(yù)度。

7. 謹(jǐn)慎選擇訴訟策略：如果無(wú)法通過(guò)協(xié)商解決糾紛，被告可以選擇向法院起訴。在選擇訴訟策略時(shí)，被告應(yīng)咨詢專業(yè)律師的意見(jiàn)，并充分了解訴訟過(guò)程和風(fēng)險(xiǎn)。

總之，被告在處理工程合同糾紛時(shí)，需要保持冷靜、溝通順暢，合理保護(hù)自己的合法權(quán)益，并根據(jù)實(shí)際情況選擇最合適的解決方式。